مجاورت کشور مالزی با خط استوا و دریاهای مختلف سبب شده هر دو بخش این کشور آب و هوایی گرم و پر باران داشته باشد.در همه قسمت های کشور،دمای هوا در سراسر سال،بین 21 تا 32 درجه سانتی گراد است و میانگین آن در نواحی پست ساحلی،26 درجه سانتی گراد است.مناطق ییلاقی واقع در ارتفاعات تا حدودی آب و هوای خنک تری دارند.اختلاف دما بین ماه های خشک و پر باران،بین دو تا چهار درجه سانتی گراد است.رطوبت متوسط هوا در این کشور،بالا و حدود هشتاد درصد است.

به دلیل وزش بادهای موسمی از شمال شرقی،ماه اکتبر(مهر) تا مارس(اسفند) باعث بارش باران های شدیدی در سواحل شرقی مالزی،ساراواک و صباح می شود.باد های موسمی جنوب غربی که بین ماه های می و سپتامبر (اردیبهشت تا شهریور)می وزد،باعث می شود هوای خشک تری در تمام کشور –به جز ساحل غربی-حاکم شود.در این فصل در ساحل غربی،بارندگی وجود دارد.در مالزی،بادهای شمال شرقی نسبت به بادهای جنوب غربی، بیشتر باران زا هستند.کم باران ترین منطقه،حوالی پایتخت و پر باران ترین منطقه،تپه های مکس ولز می باشد و می توان گفت بارندگی در مالزی،به طور متوسط،حدود ده برابر ایران است.